1、兽用抗病毒药物缺乏
兽用抗病毒西药禁用，抗病毒中药疗效不明显，病毒性疾病治疗药物出现空白，市场上中药制剂随意复方抗病毒西药的违法现象竟然成为一大“迈点”。
2、国标兽药推广阻力很大
国标兽药应用对临床兽医水平有较高的要求；临床滥用药现象严重，耐药菌毒株不断增多，国标单方药疗效欠佳，联合用药成本又增加。市场所谓“一针治百病”的违法、违规大处方兽药仍占市场主流。
3、兽药市场混乱，不公平竞争现象严重
各个兽药生产厂家 “八仙过海，各显神通”，比谁家的价格低，比谁家的商品名起得好，比谁家的复方独特，比谁家的拌料量大，比谁家写的适应证更有煽动性等等，违法违规现象屡见不鲜。
4、 新兽药开发压力很大
市场上的“新兽药”多为拥有一个很有吸引力的商品名、华美的包装及没有科学依据的大处方，许多生产企业的产品研发也就是在这方面下功夫，大多数企业不愿意在真正的新兽药开发上投资；质量监控对复方兽药开发有一定的限制。新兽药研制周期长，申报手续多等，给新兽药开发带来一定的压力。
5、 兽药产业变幻莫测
现有企业面临转变，有经销商转变为大的养殖场养殖集团，但是这样的养殖场进攻风险大，面临赊账甚至欠款问题，成功率也比较低，所以兽药产业步入低谷。
