生态学（Ecology）是研究有机体及其与周围环境相互关系的一门重要学科。“生态学”一词是由德国生物学家海克尔1866年最早提出的。
从人类的角度来看，健康的生态系统能够在维持它们复杂性的同时满足人类的需求。
生态学基本原理的应用思路是模仿自然生态系统的生物生产、能量流动、物质循环和信息传递而建立起人类社会组织，以自然能流为主，尽量减少人工附加能源，寻求以尽量小的消耗产生最大的综合效益，解决目前人类面临的各种生存环境危机。可持续发展观念协调社会与人的发展之间的关系，包括生态环境、经济、社会的可持续发展，但最根本的是生态环境的可持续发展。
事实上造成当代世界面临的空前严重的生态危机的重要原因就是以往人类对自然的错误认识。工业文明以来，人类凭借自认为先进的“高科技”试图主宰、征服自然，这种严重错误的观念和行为虽然带来了经济的飞跃，但造成的环境问题却是不可弥补的。人类是生物界中的一分子，因此必须与自然界和谐共生，共同发展。在计算和衡量经济生产中，不应认为自然资源是没有价值的或者认为是无限的，而是要用生态价值的观念，考虑到经济发展对环境的破坏和影响，利用科技的进步，将破坏降低到最大限度，同时倡导一种有利于物质良性循环的消费方式，即适可而止、持续、健康的消费观。
为了解决人类和动物疫病的困扰，我们也必须遵循这样的生态学思路。任何生物的生存都不是孤立的，病原体也不例外。病原生态学（Patho-ecology）是一门新型的学科，是研究病原与宿主相互关系的科学，主要从系统生态学的角度研究疾病在时空中的发生、发展的规律和控制方法，病原生态学基本上属于医学生态学的范畴。病原生态学涉及到两个方面的重要研究内容：病原和宿主。环境在其中起到重要的影响作用，有时甚至起决定作用。根据病原与宿主的关系，宿主可以被分为六种类型：病原携带者、易感者、潜伏感染者、临床症状者、病死者和免疫者。病原生态学研究发现，病原的爆发指数越低，继承免疫越弱，群体宿主发病的可能性越高，传播指数越大；病原的爆发指数越高，继承免疫越强，宿主群体发病可能性越低，传播指数越小。
例如，SARS病毒的携带者至今仍然是个谜，SARS的爆发指数非常低，但SARS的传播指数非常高；AIDS的爆发指数也低，但AIDS的发病率高，传播指数也高；Ebola病毒的爆发指数低，但出血热的致死率高，传播指数高；疯狗只有通过撕咬人体才能传播狂犬病，爆发指数很低，如果不加人为控制，传播指数高，而且疾病非常严重，人体感染狂犬病后100%死亡。流感的类型较多，如果从其单一类型考虑，每一种类型的流感爆发指数也较低。但一旦发生，通过空气传播，流感病毒的传播指数高。
由于流感的复杂性和不完全交叉免疫，流感的致死率低，病情1周左右结束。美国科学家的研究显示，1918-1919年导致5000万人死亡的西班牙流感病毒很可能源自鸟类，实际上是禽流感的变异，死亡集中在20-40岁的年青人，机体的免疫力是导致病死的根本原因，与所谓“高致病性”似乎无关。再看一些养猪业中的例子：一个多年不发生猪传染性胃肠炎的猪场，说明该病的爆发指数低，猪群的继承免疫将逐年衰减，一旦爆发该病，则传播指数非常高，会出现一种猝不及防的态势。多年不发生口蹄疫的地区，多年不发生蓝耳病的地区，该两种病的爆发指数较低，若一旦发生口蹄疫和蓝耳病，后果将非常严重。
影响传播指数高低的因素是传播媒介以及病原在该传播途径中的生存能力。传播速度越快，传播指数越高；病原生存能力越强，传播指数越高。通过空气或水源传播的病原，往往传播指数较高。随着疫苗接种的反复进行，病原的爆发指数越来越高（疫苗亦为病原），病原传播速度将越来越慢，继承免疫的作用在逐渐升高，生物安全的作用会逐渐减少。所以，爆发指数越大的病原，机体群体的继承免疫发挥的作用也越大。爆发指数越小的病原，机体的继承免疫发挥的作用就越小，生物安全就显得比较重要。但过渡强调生物安全，就会越削弱继承免疫的发挥。生物安全和继承免疫是一对矛盾，前者费时费力，后者完全依靠宿主机体，有点“听天由命”的意味。但就是这样的“听天由命”却造就了现代丰富多彩的大自然。让我们再看一些例子。
德国媒体引用德国过敏症专家协会专家基尔斯滕斯?容格的话说，在孩子早期成长过程中，身体的免疫系统需要一些病菌的“刺激”，从而使其达到最强大的状态。父母在家庭清洁卫生方面不该走极端，每周多次用消毒剂清洁房屋是完全没有必要的。在柏林墙倒塌之后开展的一次最著名的研究结果显示，东德人罹患过敏症、气喘和其他自体免疫性疾病的人比较少，而相对富有和洁净、可轻易获得抗生素和疫苗的西德人当中患有大规模使用抗生素、消毒药和重金属来进行环境的杀菌及消毒终究会降低大量病原的爆发指数，但却提高了其传播指数，三大污染终究会给人类带来严重的灾难，给养殖业带来严重的灾难。
综上所述，生物隔绝是某些疾病爆发的根本原因。我们必须想法设法提高而不是降低某些疾病的爆发指数。只有这样，才能提高机体的继承免疫力，从而降低某些病原的传播指数。
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